منابع آگاه خبر داده‌اند كه تعدادى از فرماندهان سپاه پاسداران ايران در حالى در كنار فرماندهان شبه‌نظامیان شیعه موسوم به «حشد الشعبی»، در اتاق عمليات مشترک باز پس گیری فلوجه حضور دارند كه عكس‌هايى از آیت‌الله خمینی، بنیان‌گذار جمهوری اسلامی در آنجا نصب شده است. این فرماندهان همچنین مکالماتی از راه بی‌سیم با زبان فارسی انجام می‌دهند.
برخى از سايت‌های خبرى ایران عكس‌هايى از برخی فرماندهان نظامی ایرانی از جمله «محمد پاکپور» فرمانده نیروی زمینی سپاه پاسداران منتشر کرده‌اند، که به همراه قاسم سلیمانی فرمانده سپاه قدس، شاخه برون مرزی سپاه پاسداران ایران، در مناطق اطراف فلوجه حضور داشت.
از سوى دیگر، «جیم مویر» خبرنگار بی‌بی‌سی که اخبار نبرد علیه گروه تروريستى داعش را در فلوجه پوشش می‌دهد، در گزارشى گفته كه شبه‌نظامیان حشد شعبی (بسیج مردمی) که قاسم سلیمانی آنها را رهبری می‌کند، از طریق بی‌سیم به زبان فارسی گفتگو می‌کنند و از بى‌سيم اتاق عملیات مشترک نيز مخلوطی از صحبت‌های فارسی و عربی شنيده مى‌شود.
او اضافه کرده است: «تنها نیروهای ارتش عراق هستند که از طریق دستگاه‌های بی‌سيم"تاکی‌واکی" به زبان عربی صحبت می‌کنند».
مویر همچنین از نصب عكس‌هاى خمينى در اتاق عملیات نظامی فلوجه و وجود شعارهای «ایران متشکریم» و «قاسم سلیمانی متشکریم» بر روی دیوارهای بخش‌های آزاد شده شهر فلوجه خبر داد.
ناظران و سياستمداران نگران آنند كه به مانند دفعات گذشته، اين عملیات که فرماندهان و مستشاران ایرانی بر آن نظارت می‌کنند به جای عملیات آزادسازی فلوجه از دست داعش، به اعمال انتقام‌جویانه از مردم سنى مذهب شهر فلوجه، تبدیل شود.
پیشتر نمایندگان استان الانبار در پارلمان عراق، مخالفت خود را با حضور قاسم سیلمانی و دیگر فرماندهان نظامی ایران در این نبردها اعلام کرده و آن را نشانگر بُعد فرقه‌ای این عملیات دانسته‌اند. در مقابل، هر دو دولت تهران و بغداد با خارج کردن نیروهای ایرانی از عراق مخالفت کرده‌اند.
