سید محمود علوی وزیر اطلاعات ایران که پیشتر مدعی شده بود، 5 روز پیش از کشته‌شدن محسن فخری‌زاده از چهره‌های سرشناس برنامه هسته‌ای ایران از این حمله مطلع بود، روز یکشنبه 14 فوریه 2021 گفت که عامل اصلی ترور فخری‌زاده از کارکنان اخراجی نیروهای مسلح بود.
به گزارش خبرگزاری ایسنا علوی گفت: «عامل اصلی تدارک ترور فخری‌زاده که از کارکنان اخراجی نیروهای مسلح بود، قبل از عملیات از کشور خارج شده بود و تحت تعقیب است.»
او همچنین مدعی شد که پس از ترور فخری‌زاده اسرائیل «همچنان قصد انجام شرارت‌های متعدد دیگری را در کشور داشت که با هوشیاری سربازان گمنام امام زمان وزارت اطلاعات شناسایی و خنثی شد و افرادی نیز در این رابطه شناسایی شدند.»
علوی شامگاه دوشنبه 8 فوریه 2021 در یک برنامه تلویزیونی فاش کرده بود که وزارت اطلاعات، اخطارهایی را درباره نشانه‌های اجرای این عملیات در 5 روز پیش از ترور را داده و نسبت به این که «دشمن» در حال برنامه ریزی برای ترور فخری‌زاده در نقطه‌ای است که عملیات اجرا گردید، هشداردهی کرده بود.
وزیر اطلاعات تأکید کرد شخصی که مقدمات اولیه ترور را فراهم کرد، یکی از اعضای نیروهای مسلح است.
علوی همچنین گفت: «از آنجا که وزارت اطلاعات، اجازه انجام اقدامات اطلاعاتی در نیروهای مسلح را نداشت، این وزارت خانه از نیروهای مسلح خواست تا نماینده‌ای تعیین کنند تا در مورد احتمال جلوگیری از اجرای عملیاتی علیه فخری‌زاده کار کند اما متأسفانه عملیات قبل از شروع به کار این نماینده، انجام شد.»
او در ادامه توضیح داده بود: «ما اطلاعاتی در مورد محل ترور داشتیم اما نه در خصوص تاریخ اجرای ترور فخری‌زاده از اعضای نیروهای مسلح بود و شخصی که مقدمات ترور را فراهم کرده نیز عضو نیروهای مسلح است. ما در وزارت اطلاعات نمی‌توانیم وارد امور اطلاعاتی نیروهای مسلح بشویم بنابراین ما از نیروهای مسلح خواستیم تا نماینده‌ای برای بررسی نقشه ترور بفرستند اما متأسفانه عملیات قبل از اعزام وی انجام شد.»
محسن فخری‌زاده از فرماندهان برجسته سپاه پاسداران و یکی از مهم‌ترین چهره‌های برنامه هسته‌ای ایران،27 نوامبر 2020 در جریان حمله‌ای در آبسرد در دماوند کشته شد. پس از آن رسانه‌های نزدیک به سپاه پاسداران و شماری از مقامات دولتی، گزارش‌های ضد و نقیضی پیرامون شرح کشته شدن او را مطرح ساختند.
